Necesita ambos en diferentes lugares. Como menciona @Bsch4777, debe poner su ITIN en lugar de ese Seguro Social en la sección Personal Information (o My Information). Este es el número que tiene que aparecer en la Forma 1040 y cualquier otro anexo que incluye.
Pero, cuando esté rellenando la sección de la Forma W-2, habrá un espacio para incluir el SSN que aparece en ese documento. Para que el IRS cuadre sus ingresos con su ITIN, tiene que poner el "número" de Seguro Social que aparece en el W-2 en ese espacio.
Si no lo hace, puede ser que la declaración o sea rechazada, o, más tarde, recibe otras cartas para resolver una discrepancia con las actas del IRS.